Si usas el servicio CloudFlare, debes realizar 2 configuraciones:
1. Agregar el registro CNAME en menú DNS > Records > Botón Add Record
- Type: CNAME
- Name: www o el subdominio elegido
- Target: El código largo que se le envió por email (exactamente igual)
- Proxy: Desactivado
Guardar el registro.

2. En Name debe quedar con www o el subdominio que se le indique por email y el proxy deshabilitado.

3. Configurar el SSL en menú SSL/TLS > Overview > Botón Configure

4. Seleccionar Custom SSL/TLS > Opción Full > Botón Save

Esta última configuración es solo para generar el certificado y para vincular con nuestros Servidores. Si su web dejó de cargar con esta configuración, luego de la vinculación puede regresarlo a como estaba originalmente.
Eso es todo, envíe por email fotos de su configuración para que sea revisado.